Fungsi carian sedang dalam pembinaan.
Fungsi carian sedang dalam pembinaan.

The original paper is in English. Non-English content has been machine-translated and may contain typographical errors or mistranslations. ex. Some numerals are expressed as "XNUMX".
Copyrights notice

The original paper is in English. Non-English content has been machine-translated and may contain typographical errors or mistranslations. Copyrights notice

Exact Algorithms for Finding a Minimum Reaction Cut under a Boolean Model of Metabolic Networks Algoritma Tepat untuk Mencari Potongan Reaksi Minimum di bawah Model Boolean Rangkaian Metabolik

Takeyuki TAMURA, Tatsuya AKUTSU

  • pandangan teks lengkap

    0

  • Petikan Ini

Ringkasan:

Potongan tindak balas ialah satu set tindak balas kimia yang penghapusannya menghalang operasi tindak balas yang diberikan atau pengeluaran sebatian kimia tertentu. Dalam makalah ini, kami mengkaji dua masalah ReactionCut dan MD-ReactionCut untuk mengira pemotongan tindak balas minimum rangkaian metabolik di bawah model Boolean. Masalah ini adalah berdasarkan model keseimbangan fluks dan model kerosakan minimum masing-masing. Kami menunjukkan bahawa ReactionCut dan MD-ReactionCut adalah NP-hard walaupun tahap luar maksimum nod tindak balas (Kkeluar) adalah satu. Kami juga hadirkan O(1.822n), O(1.959n) dan o(2n) algoritma masa untuk MD-ReactionCut dengan Kkeluar=2, 3, k masing-masing di mana n ialah bilangan nod tindak balas dan k adalah pemalar. Algoritma yang sama juga berfungsi untuk ReactionCut jika tiada kitaran terarah. Tambahan pula, kami membentangkan 2O((log n)) algoritma masa, yang lebih cepat daripada O((1+ε)n) untuk sebarang pemalar positif ε, untuk kes planar MD-ReactionCut di bawah kekangan yang munasabah menggunakan algoritma pemisah Lipton dan Tarjan.

Jawatankuasa
IEICE TRANSACTIONS on Fundamentals Vol.E93-A No.8 pp.1497-1507
Tarikh penerbitan
2010/08/01
Diumumkan
ISSN dalam talian
1745-1337
DOI
10.1587/transfun.E93.A.1497
Jenis Manuskrip
PAPER
kategori
Algoritma dan Struktur Data

Pengarang

Kata kunci

Contents [show]