Fungsi carian sedang dalam pembinaan.
Fungsi carian sedang dalam pembinaan.

The original paper is in English. Non-English content has been machine-translated and may contain typographical errors or mistranslations. ex. Some numerals are expressed as "XNUMX".
Copyrights notice

The original paper is in English. Non-English content has been machine-translated and may contain typographical errors or mistranslations. Copyrights notice

MicroRNA Expression Profiles for Classification and Analysis of Tumor Samples Profil Ekspresi MicroRNA untuk Pengelasan dan Analisis Sampel Tumor

Dang Hung TRAN, Tu Bao HO, Tho Hoan PHAM, Kenji SATOU

  • pandangan teks lengkap

    0

  • Petikan Ini

Ringkasan:

Satu jenis RNA bukan pengekodan berfungsi, mikroRNA (miRNA), membentuk kelas RNA endogen yang boleh mempunyai peranan pengawalseliaan yang penting dalam haiwan dan tumbuhan dengan menyasarkan transkrip untuk penindasan pembelahan atau terjemahan. Penyelidikan mengenai kedua-dua pendekatan eksperimen dan pengiraan telah menunjukkan bahawa miRNA memang terlibat dalam perkembangan dan perkembangan kanser manusia. Walau bagaimanapun, miRNA yang menyumbang lebih banyak maklumat kepada perbezaan antara sampel normal dan tumor (tisu) masih tidak dapat ditentukan. Baru-baru ini, teknologi microarray throughput tinggi digunakan sebagai teknik yang berkuasa untuk mengukur tahap ekspresi miRNA dalam sel. Menganalisis data ungkapan ini boleh membolehkan kita menentukan peranan fungsi miRNA dalam sel hidup. Dalam makalah ini, kami membentangkan kaedah pengiraan untuk (1) meramalkan tisu tumor menggunakan profil ekspresi miRNA throughput tinggi; (2) mencari miRNA bermaklumat yang menunjukkan perbezaan tahap ekspresi yang kuat dalam tisu tumor. Untuk tujuan ini, kami melakukan kaedah berasaskan mesin vektor sokongan (SVM) untuk memeriksa secara mendalam satu set data ekspresi miRNA terkini. Keputusan eksperimen menunjukkan bahawa kaedah berasaskan SVM mengatasi kaedah pembelajaran diselia yang lain seperti pepohon keputusan, rangkaian Bayesian, dan rangkaian neural perambatan belakang. Tambahan pula, dengan menggunakan maklumat sasaran miRNA dan anotasi Gene Ontology, kami menunjukkan bahawa miRNA bermaklumat mempunyai bukti kukuh yang berkaitan dengan beberapa jenis kanser manusia termasuk kanser payudara, paru-paru dan kolon.

Jawatankuasa
IEICE TRANSACTIONS on Information Vol.E94-D No.3 pp.416-422
Tarikh penerbitan
2011/03/01
Diumumkan
ISSN dalam talian
1745-1361
DOI
10.1587/transinf.E94.D.416
Jenis Manuskrip
Special Section PAPER (Special Section on Knowledge Discovery, Data Mining and Creativity Support System)
kategori

Pengarang

Kata kunci

Contents [show]